شناسایی باکتری عامل لکه نواری غلات از روی چندمیزبان براساس توالی یابی ناحیه 16s-23s(ITS)Rdna

نمونه هایی از برگ های دارای علائم بیماری نواری باکتریایی از روی برگ های گندم، جو، للیوم و فالاریس در مزارع گندم وجوی منطقه ارزوئیه کرمان جمع آوری و باکتری عامل آن جداسازی شد. این باکتری هامیله ای شکل، گرم منفی ، متحرک و بر روی محیط آگار غذایی حاوی گلوکز، دارای کلنی های لعابدار و زردرنگ بودند. شناسایی جدایه ها براساس توالی 16s-23s(ITS) rDNA با کمک پرایمرهای یونیورسال مربوط به این توالی انجام شد. DNA ژنومی استخراج و واکنش زنجیره ای پلیمراز به کمک پرایمرهای 16s uni 1330 و uni 322 anti23s انجام گرفت. محصولات روی ژل آگارز 1/2 درصد بار گذاری شد. پس از تعیین توالی محصولات PCR چهار جدایه نماینده ازمیزبان های گندم، جو، للیوم و فالاریس، توالی ها به کمک نرم افزار Seqman اصلاح و در پایگاه اینترنتی NCBI ، Blas شدند و میزان شباهت توالی های مورد نظر با توالی های موجود در بانک ژن بررسی شد. درخت فیلوژنی جدایه ها بانرم افزار MEGA5 به روش neighborjoining ترسیم شد. نتایج نشان داد که جدایه های مورد بررسی با 100 درصد شباهت به جدایه استاندارد Xanthomonas translucenspv. translucens با شماره دسترسی Ay994098 در کنار آن قرار گرفتندفلذا به عنوان Xanthomonas translucenspv. translucens شناسایی شدند.

Keywords:

گندم , جو , Xanthomonastranslucens pv. Translucens , لکه نواری باکتریایی غلات