شناسایی توالی فاکتور آغاز کننده ترجمه یوکاریوتی 5A (EIF 5A) در علف مورچه Cressa cretica

Publish Year: 1394
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 1,055

This Paper With 11 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

HHMM01_035

تاریخ نمایه سازی: 30 بهمن 1394

Abstract:

علف مورچه Cressa cretica به عنوان گیاه داروئی و با داشتن ترکیبات مختلف، منبع بالقوهای جهت تهیه بسیاری از داروهای گیاهی محسوب میشود. فاکتور آغازین ترجمه یوکاریوتی 5A (EIF5A) تنها پروتئین سلولی در انسان است که محتوی آمینواسید هیپوزین میباشد. اسید آمینه هیپوزین ترکیب ضروری طویل شدن در فرایند ترجمه است. فعالیت فاکتور EIF5A برای بقا و فعالیت سلولهای یوکاریوتی ضروری است. بهترین ویژگی فعالیت سلولی برای ترکیب EIF5A عملکرد آن به عنوان فاکتور انتقالی درگیر در مرحله طویل شدگی به شمار میرود. در گیاهان ژن کد کننده EIF5A در چندین گونه گیاهی شناسایی شده و کلون سازی صورت گرفته است. جهت بررسی وجود این ژن در گیاه علف مورچه تحقیقی در پژوهشکده زیست فناوری زابل در تابستان 1393 صورت گرفت. ابتدا استخراج RNA و سنتز cDNA جهت بررسی توالی این ژن انجام شد و پس از آن از طریق پرایمرهای مرتبط توالی قطعه مورد نظر از طریق PCR تکثیر گردید و محصول PCR جهت توالی یابی ارسال گردید. نتایج حاصل از تعیین توالی با استفاده از برنامه های BLAST ، CLC ، Embioss transeq ،UniProt و ClustalW مورد ارزیابی قرار گرفت. بررسی توالی نشان داد که توالی نوکلئوتیدی و پروتئینی این ژن به ترتیب به میزان 84 درصد و 95 درصد با توالیهای موجود در پایگاه داده NCBI مشابهت دارد. مشاهده همردیفی توالی مورد نظر با سایر توالیها از طریق نرم افزار Clustal W ، میزان شباهت و درجه همانندی توالی مورد نظر از این ژن در گیاه علف مورچه را ثابت کرد. ارزیابی و ردیابی ژن EIF 5A در گیاه علف مورچه، شناسائی توالی ژنهای تنظیم کننده مسیر بیان ژن به منظور اهداف اصلاحی و برنامههای نوترکیبی در این گیاه را فراهم کرد. زمانی که ژنهای تنظیم کننده مسیر بیان ژن ردیابی شوند، برنامه ریزی برای دستکاری ژنتیکی و کارهای مرتبط با آن راحت تر خواهد بود.

Authors

داود نادری

کارشناس ییوتکنولوژی، پژوهشکده زیست فناوری کشاورزی (بیوسنتر)، دانشگاه زابل

نفیسه مهدی نژاد

استادیار گروه بیوتکنولوژی و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل

لیلا فهمیده

استادیار گروه بیوتکنولوژی و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Belda-Palazo 1 _ B., Nohales, M., Rambla, J., Aceia, J. ...
  • Caraglia M, Park MH, Wolff EC. et al. eIF5A isoforms ...
  • Chattop adhyay, M.K., Park, M.H., and Tabor, H. (2008). Hypusine ...
  • Clement, P.M., Henderson, C.A., Jenkins, Z.A., S mit-McBride, Z., Wolf, ...
  • Doerfel, L.K., Wohlgemuth, I., Kothe, C., Peske, F., Urlaub, H., ...
  • Feng, H., Chen, Q., Feng, J., Zhang, J., Yang, X., ...
  • Gregio, A.P.B., Cano, V.P.S., Avaca, J.S., Valentini, S.R., and Zanelli, ...
  • Gibbon, B and Saladin, S. 2011. The role of eukaryotic ...
  • Hoque M, H anauske-Abel HM, Palumbo P. et al. 2009. ...
  • Imai, A., Matsuyama, T., Hanzawa, Y., Akiyama, T., Tamaoki, M., ...
  • Jeffries, M.S., Kiss, A.J. Smith, A.W. and Oris, J.T. 2014. ...
  • Jenkins ZA, Haag PG, Johansson HE. 2001. Human eIF5A2 _ ...
  • Li, C.H., Ohn, T., Ivanov, P., Tisdale, S., and Anderson, ...
  • Loomis, M.D. (1974) Overcoming problems of phenolics and quinines in ...
  • Mandal, S., Mandal, A., Johansson, H.E., Orjalo, A. V, and ...
  • Maier, B. , Ogihara, T. , Trace, A.P .Tersey, S ...
  • Nishimura, K., Lee, S., Park, J., and Park, M. (20 ...
  • eukaryotes. Amino Acid. 2010;38:491 -500 ...
  • Park MH, Wolff EC, Folk JE. Hypusine: its p _ ...
  • Park, M. (2006). The po st-translationl synthesis _ polyamine -derived ...
  • Ren, B., Chen, Q., Hong, S., Zhao, W., Feng, J., ...
  • Rato C, Amirova S.R, Bates D.G, Stansfield I, Wallace H.M ...
  • Tripathi, L. and Tripathi, J.N. (2003). Role of biotechnology in ...
  • Wang, L, Xu, C., Wang, C., and Wang, Y. (2012). ...
  • Wang TW, Lu L, Zhang CG, Taylor C, Thompson JE ...
  • Wang TW, Zhang CG, Wu W, Nowack LM, Madey E, ...
  • Wolff, E. C., Kang, K. R., Kim, Y.S., and Park, ...
  • Xu, J., Zhang, B., Jiang, C., and Ming, F. (2011). ...
  • Zanelli, C.F. and Valentini, S.R. 2007. Is there a role ...
  • نمایش کامل مراجع