استفاده از الگوهای مشترک موجود در هاپلوتیپ ها برای بهبود پیش بینی وضعیت بیماری دیابت نوع اول

Publish Year: 1387
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 1,552

This Paper With 7 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

ICEE16_034

تاریخ نمایه سازی: 6 اسفند 1386

Abstract:

افزایش اطلاعات در مورد ساختار و فرکانس هاپلوتیپ، باعث می شود که بتوان از مزایای اطلاعات هاپلوتیپ در مکتن یابی رابطه ای بیماری ها در مطالعات کنترل - مورد استفاده کنیم. روش های رده بندی سعی می کنند مجموعه مکان هایی در ژنوتیپ بر گزینند که به بهترین وجه فنوتیپ را پیش گویی کنند. اما ممکن است این مکان ها به صورت تصادفی انتخاب شوند. ما برای اینکه فرایند رده بندی افراد بیمار و سالم را بهبود دهیم ابتدا به وسیله یکی از روش های موجود کاوش الگوهای هاپلوتیپ مشترک که با خوشه بندی الگوها را پیدا می کند، مجموعه مکان های مهم را پیدا می کنیم سپس از روی این مکان ها مدل سازی را با استفاده از درخت های تصمیم گیری و رگرسیون (CART) با Cross-Validation با folding ده تایی انجام می دهیم. این روش روی داده های بیماری دیابت نوع اول اعمال شد. با اعمال مدل سازی بر مجموعه مکان های مهم در هاپلوتیپ های افراد جمعیت نسبت به مدل سازی بر روی تمام نشانگرها افزایش دقت مدل سازی و پیشگویی 5 درصد حاصل شد. دقت این روش با انجام آزمون جایگشت با 1000 بار تکرار و رسم نمودار ROC ارزیابی شد.

Keywords:

Authors

زهرا ماهور

دانشکده برق و کامپیوتر، دانشگاه صنعتی اصفهان

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • C. Durrant, K.T. Zondervan, L.R Cardon., "Linkage disequilibrium mapping via ...
  • H.T.T. Toivonen, P. Onkamo, ،A survey of data mining methods ...
  • S.S. Young and N. Ge, ،Recursive partitioning analysis of complex ...
  • N.R. Cook, R.Y.L. Zee, and P.M. Ridker, , ;Tree and ...
  • M. Waddell, D. Page, F. Zhan, et al., ?Predicting cancer ...
  • J. Molitor , P. Marjoram , D. Thomas, ،#Fine-Scale Mapping ...
  • E.R.B. Waldron, J.C. Whittaker, D.J Balding., Fine Mapping of Disease ...
  • K. Humphreys and M. Iles _، #ine-scale mapping in case-control ...
  • H.T.T. Toivonen, P. Onkamo, K. Vasko, et al., 4Gene mapping ...
  • P. Sevon, H. Toivonen, and V. Ollikainen, ،TreeDT: Tree pattern ...
  • J. Li , T. Jiang, . 'Hap lotype-based linkage disequilibrium ...
  • D. Steinberg , P. Co lla, *CART-C lassication and Regression ...
  • M. Herr, F. Dudbridge., «Evaluation of fine mapping strategies for ...
  • J.S. Liu , C. Sabatti , J. Teng , BJ. ...
  • M. Weidong , B. Dumitru , N. Hundewale , S. ...
  • نمایش کامل مراجع