پویش ژنومی نشانه های انتخاب در گاومیش های خوزستانی و مازندرانی

شناسایی مناطق ژنومی که هدف انتخاب بودهاند، از بحثبرانگیزترین مباحث در حوزه تحقیقات ژنتیک حیوانی، بهخصوص در حیوانات اهلی است. در این مطالعه، پویش کل ژنوم برای شناسایی مناطقی از ژنوم که در گاومیشهای خوزستانی و مازندرانی هدف انتخابهای طبیعی یا مصنوعی قرار گرفتهاند، اجرا شده است. بدین منظور 141 راس گاومیش رودخانهای شامل جمعیتهای خوزستانی )121راس( و مازندرانی )22 راس(، به وسیله آرایههای ژنومیکی 90K Genotyping Buffalo® Axiom تعیین ژنوتیپ شدند. جهت جستجوی نشانههای انتخاب از برآوردگر نااریب FST( θ )استفاده شد. در مجموع 23 منطقه که نشانگرهای SNP آنها باالتر از 1/0 درصد حد بالای توزیع تجربی FST بود، بهعنوان نشانههای انتخاب شناسایی شده و مورد بررسیهای بیشتر قرار گرفتند. بعد از انطباق مناطق ژنومی انتخابشده با مناطق ژنومی متناظر آن روی ژنوم گاو )Genome Taurus Bos 1.UMD3 ،)24 ژن و 22 QTL شناسایی شد. تعدادی از این ژنها در مطالعات قبلی نیز بهعنوان نشانههای انتخاب گزارش شدهاند. برخی از این ژنها احتمالا در مسیرهای بیولوژیکی که با اهلیشدن حیوانات )توسعه مغز و عملکردهای رفتاری، پیگماسیون و آداپتهشدن به محیط زندگی و شرایط جغرافیایی( و تولید شیرمرتبط میباشند، درگیرند. بررسیها همچنین نشان داد که QTLهای شناساییشده در این تحقیق با صفات مهم اقتصادی از جمله صفات مرتبط با راندمان تبدیل غذایی، وزن بدن، چربی زیرپوستی، افزایش وزن روزانه، تیپ، تردی گوشت، ترکیبات شیر، اتصاالت پستانی، اندازه گوساله و گوسالهزایی آسان ارتباط دارند. به هرحال جهت شناسایی نقش دقیق این ژنها و QTLها الزم است مطالعات پیوستگی و عملکردی بیشتری انجام گیرد.

Keywords:

پویش ژنوم , شاخص تمایز جمعیتی , گاومیش خوزستانی و مازندرانی , نشانههای انتخاب