شناسایی پروتیین هایی با خاصیت الیسیتوری از باکتری Xanthomonascitri subsp. Citri

الگوهای مولکولی مرتبط با میکروب MAMP نقش کلیدی در فعال سازی ایمنی پایه در جانوران و گیاهان بازی میکنند. در مطالعات اولیه ما مشخص شد که عصاره پروتیینی Xanthomonascitri subsp. Citri عامل بیماری شانکر مرکبات بر روی جفت موتانت گیاه آرابیدوپسیس fls2 x efr که نسبت به فلاژلین و EF-Tu ممپ های معمول در باکتری ها پاسخ دهی ندارد، فعالیت ممپ قابل توجهی دارد. در این مطالعه تلاش شد تا عصاره پروتیینی فعال این باکتری خالص سازی و آنالیز شود. برای تعیین خاصیت الیسیتوری جدایه های مختلف و در طول مراحل خالص سازی روش زیست سنجی تولید اتیلن مورد استفاده قرار گرفت. برای خالص سازی پروتیین های فعال عصاره پروتیینی از دستگاه FPLC مجهز شده به ستون Hitrap Q FF استفاده شد. فراکسیون های فعال FPLC با استفاده از طیف سنجی جرمی متوالی آنالیز شدند تا پروتیین های آن شناسایی شود. آنالیز MS/MS توانست بیش از 60 پروتیین در فراکسیون فعال از FPLC شناسایی کند. عملکرد بسیاری از پروتیین های شناسایی شده از طریق آنالیز توالی آنها در ابزارهای آنلاین بیوانفورماتیک مختلف تعیین شد. در بررسی های پیشین نقطه ایزوالکتریک و وزن مولکولی بخش فعال عصاره پروتیین زانتوموناس حدود 8 و 10 کیلودالتون تعیین شده بود. از بین پروتیین های شناسایی شده تنها چهار پروتیین با ویژگی های مشابه شناسایی شدند که شامل csrA تنظیم گر ذخیره کربن ، cspA پروتیین شوک سرمایی و یک پروتیین محافظت شده بودند.

Keywords:

الیسیتور , زانتوموناس پروتیین , اتیلن