آنالیز توالی ژن CI پوتی ویروس آلوده کننده گیاه پنیرک در ایران

پوتیویروسها بزرگترین و گسترده ترین ویروس های با ژنوم RNA گیاهی هستند که سبب ایجاد خسارت قابلتوجهی در طیف وسیعی از گیاهان میشوند . در این بررسی تعدادی نمونه برگی از گیاه پنیرک (Malva spp.) با علائم موزائیک خفیف تا شدید، بدشکلی برگ و رگبرگ روشنی از استان گلستان جمع آوری گردید. پس از استخراج آر. ان.ای کل از نمونه های برگی، با استفاده از آزمون RT-PCR و با کمک آغازگرهای دژنره، بخشی از ناحیه ژنومی (CI) cylindrical inclusion، تکثیر شد. محصول PCR یک جدایه پس از جداسازی و خالص سازی از ژل در ناقل پلاسمیدی pTG19-T وارد و در سویه +5 باکتری Escherichia coli همسانه سازی شد. دی. ان.ای پلاسمید نوترکیب پس از استخراج مورد توالییابی قرار گرفت. طول توالی نوکلئوتیدی به دست آمده از ژن CI این جدایه بهاندازه 540 نوکلئوتید بود. آنالیز BLASTn نشان داد که پوتیویروس آلودهکننده پنیرک دارای بیشترین یکسانی نوکلئوتیدی (identity) (حدود 70 درصد) با ویروس موزائیک زرد لوبیا (Bean yellow mosaic virus) و ویروس لکه حلقوی خربزه درختی ( Papaya ringspot (virus و بر اساس BLASTp بیشترین یکسانی آمینواسیدی (حدود 65 درصد) را با ویروس موزائیک زرد لوبیا و ویروس آبله آلو ( Plum (pox virus دارد. میزان یکسانی توالی نوکلئوتیدی و آمینواسیدی کمتر از آستانه تعیین حدود و گستره گونه در جنس پوتیویروس است، ازاینرو پوتیویروس آلوده کننده گیاه پنیرک میتواند یک گونه جدید از این جنس باشد. همچنین این احتمال وجود دارد که قطعه تعیین توالی شده مربوط به ویروس رگبرگ روشنی پنیرک (Malva vein clearing virus-MVCV) باشد. ازآنجاکه بخش CI این پوتی-ویروس در بانک ژن موجود نبود، جهت اظهارنظر قطعی نیاز به تعیین توالی کل ژنوم جدایه ویروسی است.