شناسایی و بررسی خصوصیات مولکولی ویروس موزاییک کدو Squash mosaic virus در استان های خراسان رضوی، جنوبی و مازندران

ویروس موزاییک کدو SqMV یکی از مهم ترین ویروس های آلوده کننده گیاهان خانواده کدو در جهان می باشد. این ویروس متعلق به خانواده Sequviridae و جنس Comovirus بوده، ژنوم آن شامل دو قطعه RNA تک رشته ای مثبت می باشد. در طی ماه های فروردین تا مرداد ماه سال 1393 ، از گیاهان دارای علایم موزاییک، زردی و پیچیدگی سطح برگ در مزارع کدو، خربزه و هندوانه استان های خراسان رضوی، جنوبی و مازندران نمونه برداری صورت گرفت. آلودگی نمونه های مورد نظر توسط روش RT-PCR با استفاده از آغازگرهای اختصاصی مورد بررسی قرار گرفت، از میان 176 نمونه گیاهی جمع آوری شده 10 نمونه آلوده به ویروس موزاییک کدو تشخیص داده شدند، نمونه های آلوده پس از همسانه سازی تعیین ترادف گردیدند جهت تعیین جایگاه تکاملی این جدایه ها در مقایسه با سایر جدایه های موجود، درخت فیلوژنتیکی توسط نرم افزار MEGA6 رسم گردید. نتایج حاصله بیانگر آن بود که براساس مقایسه ترادف نوکلیوتیدی و آمینو اسیدی، جدایه های ایرانی در دو گروه جداگانه قرار می گیرند

Keywords:

ایران , واکنش زنجیره ای پلی مراز , ویروس موزاییک کدو