ارزیابی تنوع ژنتیکی گندم های اینکورن غرب ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره ای

محمد مهدی پورسیاه بیدی; کیانوش چقامیرزا; صحبت بهرامی نژاد; احمد ارزانی

ارزیابی تنوع ژنتیکی گندم های اینکورن غرب ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره ای

Publish place: Journal of agricultural biotechnology، Vol: 12، Issue: 2

Publish Year: 1399

Type: Journal paper

Language: Persian

This Paper With 26 Page And PDF Format Ready To Download

DOWNLOAD Paper

Certificate
I'm the author of the paper

این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

کشاورزی > گندم

Export:

Link to this Paper:

https://civilica.com/doc/1046716

Document National Code:

JR_JOAGK-12-2_009

Index date: 16 September 2020

ارزیابی تنوع ژنتیکی گندم های اینکورن غرب ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره ای abstract

هدف: وجود تنوع ژنتیکی در گیاهان زراعی و اجداد وحشی آن ها نقش مهمی در پیشرفت برنامه های به نژادی دارد. گونه اینکورن (Triticum monococcum L. ssp. boeoticum) در نواحی غربی ایران تنوع وسیع و پراکنش جغرافیایی گسترده ای دارد. هدف از این تحقیق بررسی تنوع ژنتیکی گندم های اینکورن جمع آوری شده از این منطقه با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره ای بود. مواد و روش ها:تنوع ژنتیکی 163 ژنوتیپ گندم اینکورن جمع آوری شده از 34 مکان متفاوت از سه استان غربی ایران با استفاده از 19 جایگاه ژنی SSR از ژنوم A گندم هگزاپلویید بررسی شد. نتایج: در 163 ژنوتیپ گندم اینکورن مورد مطالعه در مجموع 151 آلل چندشکل برای 19 جایگاه ریزماهواره ای با میانگین 94/7 شناسایی شد. دامنه محتوای اطلاعات چندشکلی (PIC) در ژنوتیپ های مورد مطالعه بین 64/0 برای جایگاه ژنی Xgwm480-3A تا 89/0 برای جایگاه ژنی Xgwm4-4A متغیر بود. میانگین محتوای اطلاعات چندشکلی در ژنوتیپ های مورد مطالعه 77/0 بود. با توجه به نتایج بدست آمده جایگاه های ژنیXgwm4-4A ، Xgwm610-4A و Xgwm282-7A مناسب ترین جایگاه ها برای بررسی تنوع ژنتیکی و تمایز ژنوتیپ های مورد مطالعه گندم اینکورن تشخیص داده شدند. میانگین ضریب شانون به میزان 16/0 نشان دهنده تنوع متوسط در ژنوتیپ های تحت بررسی بود. متوسط مکان های ژنی چندشکلی در 34 جمعیت مورد مطالعه 74/36 درصد و میانگین هتروزیگوسیتی برابر 114/0 برآورد شد. بر اساس نتایج تجزیه واریانس مولکولی برای 34 جمعیت گندم اینکورن، اختلاف بین و درون جمعیت های مورد مطالعه به ترتیب 7 و 93 درصد مشاهده شد. تجزیه خوشه ای با استفاده از ضرایب جاکارد و بر اساس الگوریتم UPGMA ژنوتیپ های مورد مطالعه گندم اینکورن را در 10 گروه طبقه بندی نمود. طبق نتایج حاصل از تجزیه به مختصات اصلی دو بردار اولیه به ترتیب 33/29 و 01/24 درصد از کل واریانس ژنتیکی مولکولی را تبیین نمودند. نتیجه گیری: نتایج حکایت از مفید بودن نشانگرهای ریزماهواره در شناسایی و گروه بندی ژنوتیپ های گندم اینکورن داشت، به طوریکه از اطلاعات بدست آمده می توان در پروژه های اصلاحی، برنامه ریزی حفاظت ژرم پلاسم و ایجاد کلکسیون از جمعیت های گندم اینکورن استفاده نمود.

ارزیابی تنوع ژنتیکی گندم های اینکورن غرب ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره ای Keywords:

غرب ایران , گندم اینکورن , نشانگرهای SSR , Triticum monococcum L. ssp. boeoticum

ارزیابی تنوع ژنتیکی گندم های اینکورن غرب ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره ای authors

محمد مهدی پورسیاه بیدی

گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی، دانشگاه رازی، کرمانشاه، ایران

کیانوش چقامیرزا

گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی، دانشگاه رازی، کرمانشاه، ایران

صحبت بهرامی نژاد

گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی، دانشگاه رازی، کرمانشاه، ایران

احمد ارزانی

اصفهان اصفهان - دانشگاه صنعتی اصفهان

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :

ارتباط بین صفات کیفی دانه و نشانگرهای مولکولی SSR در برخی از ژنوتیپ های گندم نان [مقاله ژورنالی]

خارستانی هادی، نصراله نژادقمی علی اصغر، مهرابی علی اشرف (1292) ... [مقاله ژورنالی]

بررسی مولکولی تنوع ژنتیکی در لاین های دابل هاپلوئید گندم نان با استفاده از نشانگرهای SSR [مقاله ژورنالی]

عبدالهی سیسی نیر؛ محمدی سیدابوالقاسم؛ علوی کیا سید سیامک؛ صادق ...

بررسی تنوع ژنتیکی ارقام گندم نان (Triticum aestivum L.) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره [مقاله ژورنالی]

کافی هانیه، نوابپور سعید، زینلینژاد خلیل، پهلوانی محمدهادی (1397) ارزیابی ...

کوهستانی محمد؛ صادق زاده بهزاد؛ ابراهیمی محمدعلی؛ یوسفی ولی اله ...

محمدی مجید؛ میرفخرایی رضاقلی؛ عباسی علیرضا (1392) مطالعه تنوع ژنتیکی ...

نظری مریم؛ و عبدالشاهی روح اله (1393) بررسی تنوع ژنتیکی ...

واجد ابراهیمی محمدتقی؛ محمدآبادی محمدرضا؛ اسماعیلی زاده علی (1396) بررسی ...

واجدابراهیمی محمدتقی، محمدآبادی محمدرضا، اسمعیلی زاده کشکوئیه علی (1394) بررسی ...

Abdollahi-Sisi N, Mohammadi SA, Alavikia S, Sadeghzadeh B (2012) Analysis ...

Anderson JA, Churchill GA, Autrique JE et al. (1993) Optimizing ...

Arzani A, Ashraf M (2017) Cultivated ancient wheats (Triticum spp.): ...

Chambers GK, Macavoy ES (2000) Microsatellites: consensus and controversy. Comp ...

Doyle JJ, Doyle, JL (1990) Isolation of plant DNA from ...

FAO. 2017. FAOSTAT Database. Available online at: http://www.fao.org/faostat/en/#data/QC ...

Gupta PK, Varshney RK (2005) Cereal genomics: an overview. Springer ...

Ghasemi N, Mirfarkhai RH, Abbasi AS (2019) Genetic diversity of ...

Hammer K, Filatenko AA, Korzun V (2000) Microsatellite markers - ...

Harlan JR, Zohary D (1996) Cultivated einkorn=Triticum monococcum L.subsp. monococcum ...

Ismaili A, Nazarian Firoozabadi F, Samiey K. and Drikvand R ...

Jannik JL, Bink MC, Jansen RC (2001) Using complex plant ...

Kafi H, Navabpour S, Zaynali Nezhad KH, Pahlavani MH (2018) ...

Kalivas A, Xanthopoulos F, Kehagia O, Tsaftaris AS (2011) Agronomic ...

Kharestani H, Nasrolah Nejad Qomi AA, Mehrabi AA (2013) Genetic ...

Kouhestani M, Sadeghzadeh S, Ebrahimi MA, Yousefi A (2016) Identification ...

Kumar R, Kumar A, Kumar SA, Radha J (2012) Evaluation ...

Liu J, Liu L, Hou N, Zhang A (2007) Genetic ...

Mardia KV, Kent JT and Bibby JM (1979) Multivariate analysis. ...

Maxted NBV, Ford-Lloyd SL, Jury SP, Kell MA Scholten. (2006) ...

Mir Drikvand R, Khyrolahi A, Ebrahimi A, Rezvani M (2015) ...

Mizumoto K, Hirosawa S,Nakamura C, Takumi S (2002) Nuclear and ...

Mohammadi SA, Prasanna BM (2003) Analysis of genetic diversity in ...

Mohammadi M, Mirfakhraii RG, Abbasi A (2013) Genetic diversity in ...

Naghavi MR, Malaki M, Alizadeh H et al. (2009) An ...

Nazari M, Abdolshahi R (2014) Evaluation of genetic diversity in ...

Nei, M, Li WH (1979) Mathematical model for studying genetic ...

Pahlavani S, Izanloo A, Parsa S, Ghaderi MG (2016) Association ...

Pirseyedi SM, Mardi M, Naghavi MR et al. (2006) Evaluation ...

Rafalski JA, Vogel JM, Morgante M et al. (1996) Generating ...

Roussel V, Leisova L, Exbrayat F et al. (2005) SSR ...

Salehi M, Arzani A, Talebi M, Rokhzadi A (2018) Genetic ...

Salvi S, Tuberosa R (2005) To clone or not to ...

Vajed Ebrahimi MT, Mohammad Abadi MR, Esmailizadeh AK (2016) Analysis ...

Vajed Ebrahimi MT, Mohammadabadi MR, Esmailizadeh AK (2017) Genetic Diversity ...

Wang H, Wang X, Chen P, Liu D (2007) Assessment ...

Warschefsky E, Penmetsa RV, Cook DR, von Wettberg EJB (2014) ...

Williams JGK, Kubelik AR, Livak KJ et al. (1990) DNA ...

Zargani M, Ranjbar GA, Ebrahim Nejad Sh (2015) Molecular assessment ...

Zhang HY, Liu XZ, Li TS, Yang YM (2006) ...

نمایش کامل مراجع