بررسی روابط فیلوژنی وتنوع نوکلئوتید زیرواحد pasC فتوسیستم I فتوسنتزی درسه تیره گیاهان دارویی

در گیاهان رشد سلولی، تمایز اندامک ها و پلاستیدها، شکل گیری و تجمع رنگدانه ها و بیوسنتز متابولیت های ثانویه به کارایی همه اجزای فتوسنتز وابسته است. زیرواحد psaC فتوسیستم I یکی از مهم ترین اجزای فتوسنتزی است. در مطالعه حاضر، زیرواحد psaC هفده گونه گیاهی از سه تیره گیاهان دارویی شامل نعناعیان، چتریان و گاوزبانیان براساس روابط تکاملی در دوسطح توالی های نوکلئوتیدی و آمینواسیدی ارزیابی شد. برای این منظور، توالی های مورد نظر از پایگاه داده های در دسترس استخراج و درخت فیلوژنی براساس روش اتصال همسایگی نرم افزار MEGA-X ترسیم شد. تعداد رخدادهای چندشکی حاصل از تک نوکلئوتیدی SNP و شاخص های مرتبط با آن با استفاده از نرم افزار V۶.۱۲ DNAsp محاسبه شد. نتایج نشان داد که در هر دو سطح توالی های نوکلئوتیدی و آمینواسیدی دو تیره نعناعیان و گاوزبانیان به یکدیگر نزدیکترند و و تیره چتریان در فاصله دورتر از آنها در درخت فیلوژنی قرار می گیرد. ارزیابی جزئیات بیشتر در سطح درون تیرهای نشان داد که در اغلب موارد روابط تکاملی به طورمتفاوتی بین توالی های نوکلئوتیدی و آمینواسیدی ترسیم شد. همچنین تعداد رخدادهای SNP در خانواده نعناعیان برابر با ۱۹ برآورد شد که از سایر خانواده ها بیشتر بوده است. به همین ترتیب، شاخص های Pi و W-theta برابر با ۰/۰۳۷ و ۰/۰۳۸ در این خانواده میزان بیشتری را نشان دادد. دستیابی به نگاه تکاملی در مورد روابط گونه های مختلف می تواند کمک قابل توجه در طراحی برنامه های مهندسی ژنتیک و پروتئین فراهم کند.

Keywords:

چتریان , نعناعیان , گاوزبانیان , SNP