ارزیابی تنوع ژنتیکی در یک مجموعه از ژنوتیپ های گندم دوروم با استفاده از نشانگرهای هدفمند ژنی

مطالعه تنوع ژنتیکی و ساختار ژنتیکی جمعیت های گیاهی از مهمترین اجزای برنامه های به نژادی به شمار می رود. در اینمطالعه، تنوع ژنتیکی ۸۶ ژنوتیپ مختلف گندم دوروم با استفاده از نشانگرهای CBDP مورد بررسی قرار گرفت. استخراجDNA ژنومی از برگ های جوان بر اساس روش CTAB انجام شد و کیفیت DNA با استفاده از الکتروفورز ژل آگارز ۰/۸درصد تایید گردید. واکنش های تکثیری با استفاده از آغازگرهای CBDP در دستگاه ترموسایکلر Biorad در حجم ۲۰میکرولیتر انجام و قطعات تکثیر شده بر روی ژل آگارز۱/۵ درصد تفکیک شد. چهارده آغازگرCBDP در مجموع ۹۳ باندچندشکل قابل امتیازدهی تکثیر نمودند. متوسط شاخص محتوای اطلاعات چندشکل (PIC) برای آغازگرهای مورد استفادهبرابربا ۰/۳۲ بدست آمد که بیانگر کارایی خوب آغازگرهای مورد استفاده در تفکیک مواد ژنتیکی و ارزیابی تنوع موجود در بین آنها بود. دندروگرام حاصل از تجزیه کلاستر بر اساس الگوریتم Neighbor-joining ژنوتیپ های مورد بررسی را در سهگروه دسته بندی نمود. در مجموع، آغازگرهای CBDP سطح بالایی از تنوع ژنتیکی را بین ۸۶ ژنوتیپ گندم دوروم موردبررسی نشان دادند و نتایج بدست آمده مشخص کرد که نشانگرهای CBDP، نشانگرهایی مناسب و برخوردار از کاراییبالایی در مطالعات تنوع ژنتیکی می باشند.

Keywords:

تجزیه کلاستر , تنوع ژنتیکی , گندم دوروم , نشانگر DNA