ارایه یک الگوریتم مبتنی بر چگالی برای کشف خوشههای ژنی از دادههای میکروآرایه

Publish Year: 1394
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 914

This Paper With 8 Page And PDF and WORD Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

FRCNC01_021

تاریخ نمایه سازی: 14 مرداد 1394

Abstract:

یکی از موضوعات مهم در تحلیل داده های میکرو آرایه، خوشه بندی ژن ها بر اساس الگوهای بیان آن هاست. کشف ژن هایی که در شرایط خاص با هم بیان می شوند بوسیله الگوریتم های مختلف خوشه بندی صورت می پذیرد. هر کدام از روش های بکار گرفته شده برای کشف خوشه ای ژنی دارای مزایا و معایبی هستند. روش مبتنی بر چگالی به لحاظ پیدا کردن خوشه هایی با شکل های متفاوت و تشخیص نویز توانمند است. در این مقاله، یک روش جدید مبتنی بر چگالی از داده های میکروآرایه معرفی می شود. دراین روش جدید، هر داده بیان ژن بصورت یک شی و ویژگی شماره خوشه بصورت یک آرایه یک بعدی در نظر گرفته شده است. این امر سبب می شود یک ژن بتواند همزمان در چند خوشه حضور داشته باشد. نتایج بدست آمده از 30 بار اجرای الگوریتم نشان می دهد الگوریتم دقت قابل توجهی در پیدا کردن خوشه ها را داراست، بطوریکه دقت کشف شبکه های ژنی سه خوشه ای، 91% و چهار خوشه ای، 77% بوده است.

Authors

محمد محمدی

دانشگاه آزاد اسلامی واحد یاسوج واحد علوم و تحقیقات

حمید پروین

دانشگاه آزاد اسلامی واحد یاسوج واحد علوم و تحقیقات

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Ashour, W., & Sunoallah, S., Multi density DBSCAN. In Intelligent ...
  • Ester, M., Kriegel, H.-P., Sander, J., Xu, X.: A Density-Based ...
  • Elbatta, M. T., & Ashour, W. M., A Dynamic Method ...
  • Ram, A., Jalal, S., Jalal, A. S., & Kumar, M., ...
  • Amini, A., Wah, T. Y., & Saboohi, H., On density-based ...
  • Jiang, D., Pei, J., & Zhang, A., DHC: _ density-based ...
  • Brecheisen, S., Kriegel, H.-P., Pfeifle, M.: Parallel Density-Based Clustering of ...
  • Varied Density Based Spatial Clustering of Application with Noise", in ...
  • Ram, A., Jalal, S., Jalal, A., kumar, A., _ density ...
  • Ram, A, Sharma, A., Jalal, A.S., Singh, R., agrawal, A., ...
  • Bohm, C., Noll, R., Plant, C., Wac kersreuther, B.: Density-based ...
  • Loh, W.-K., Moon, Y.-S., Park, Y .-H.: Fast Density-based Clustering ...
  • نمایش کامل مراجع