ارزیابی روابط ژنتیکی برخی از ارقام و ژنوتیپ های بادام (Prunus dulcis L. ) با استفاده از نشانگر SSR

استفاده از نشانگرهای مولکولی به ویژه ریزماهواره ها به دلیل دقت بالای آنها در مطالعه ژنوم درختان میوه از اهمیت زیادی برخوردار است. در این پژوهش برای ارزیابی روابط ژنتیکی 68 رقم و ژنوتیپ بادام داخلی و خارجی از 22 مکان ریزماهواره استفاده شد. DNA ژنومی از بافت های برگی جوان استخراج و واکنش های PCR با استفاده از 22 مکان انتخاب شده (از بین 100 عدد مکان) ریزماهواره روی آن انجام شد. از مکان های بررسی شده در مجموع 167 آلل چند شکل که بین 4 تا 11 آلل در هر مکان SSRs و با متوسط 7/60 آلل بودند، مشاهده شد. از بین مکان های استفاده شده، مکان های pchgms6 و UDP97401 با داشتن تعداد آلل زیاد، آلل مؤثر بالا، قدرت تفکیک کنندگی، میزان اطلاعات چند شکلی، هتروزایگوسیتی مورد انتظار و شاخص اطلاعاتی شانون بالا، نسبت به سایر مکان های بررسی شده کارایی بهتر و مزیت بیشتری داشتند. بر اساس ماتریس تشابه، بیشترین تشابه (0/74 ) بین ژنوتیپ های 5-17 و 1-21 و کمترین تشابه بین ژنوتیپ 2-7 با مشهد 3 و ’پرلیس‘ و همچنین ژنوتیپ’4-8‘ با ’دیر رس ساوجبلاغ‘ و’ آذر‘ (0/14) مشاهده شد. برای رسم نمودار خوشه ای از روش UPGMA و ضرایب تشابه دایس بین ارقام و ژنوتیپ ها استفاده شد. براساس این روش ارقام و ژنوتیپ های بررسی شده در فاصله تشابه 0/40 به 8 گروه اصلی تقسیم شدند که متناسب با منشاء جغرافیایی و برخی خصوصیات مورفولوژیکی آنها بود.

Keywords:

بادام , تنوع ژنتیکی , توالی های ساده تکرار شونده ( ریزماهواره ها) , ماتریس تشابه