بررسی قرابت ژنتیکی ژنوتیپ های انار جنوب استان کرمان

انار (.punica granatum L) از میوه های شناخته شده بومی ایران است. در حال حاضر ایران یکی از تولیدکنندگان مهم و دارای غنی ترین ذخایر ژنتیکی انار است. اگرچه مارکرهای مبتنی بر خصوصیات مورفولوژیکی بطور گستردهای در شناسایی ارقام انار مورد استفاده قرار می گیرند، اما بدلیل اینکه بشدت متاثر از شرایط محیطی هستند کارایی زیادیندارند. در این تحقیق صفات مورفولوژیکی براساس دستورالعمل ملی آزمون های تمایز، یکنواختی و پایداری در انار ارایه شدهاست اندازه گیری شد و با استفاده از نرم افزار XLSTaT کلاستربندی شدند و در نهایت دندروگرام بر اساس ماتریس تشابهترسیم گردید. استخراج DNA ژنومی از برگهای انار جمع آوری شده انجام و تکثیر قطعه دی ان ای مورد نظر توسطواکنش زنجیره ای پلیمراز تنها با جفت آغازگر اختصاصی R21 psbE-petL / F21 psbE-petL انجام گرفت. در تمامینمونه های مورد بررسی، قطعه ای به اندازه تقریبی 700 جفت باز تکثیر شد. قطعات دی ان ای تکثیر شده پس از تخلیص،تعیین توالی شده و تعلق آنها به ژنوم کلروپلاستی انار با استفاده از نرم افزار BLAST و جستجو در NCBI بررسی و تعیینشد. ویرایش توالی های بدست آمده با استفاده از نرم افزار BioEdit و ترسیم درخت فیلوژنتیکی با کمک نرم افزارMEGA5 انجام گرفت. بررسی حاصل از نتایج صفات مورفولوژیکی و ژنتیکی نشان داد که ارقام و ژنوتیپ های موجود درمنطقه از تنوع چشمگیری برخوردارند و همچنین ناحیه بین ژنی psbE-petL به خوبی قادر به تمایز ژنوتیپ های مختلفانار و تعیین قرابت آنها با یکدیگر می باشد و میتوان از آن به عنوان نشانگر مناسب برای بررسی تنوع بین ژنوتیپ های اناراستفاده کرد.

Keywords:

تنوع ژنتیکی , ژنوم کلروپلاستی , ناحیه بین ژنی psbE/petL