تعیین اپی توپ های فضایی زنجیره سبک ایمونوگلوبولین انسان توسط ایمونوانفورماتیک

ایمونوگلوبولین ها که از زنجیره های سبک و سنگین تشکیل شده اند، گروهی از پروتئین های سرم هستند که نقش مهمی در دفاع علیه میکروارگانیسم ها برعهده دارند. زنجیره های سبک بر اساس تفاوت در انتهای کربوکسیلی ناحیه ثابت خود به دو ایزوتیپ کاپا (k) و لامبدا (λ) تقسیم می شوند. تغییرات قابل توجهی در نسبت زنجیره های کاپا به لامبدا، در بدخیمی سلول های B یا در عفونت با ویروس ایدز در دوران جنینی، ممکن است روی دهد. جهت سنجش دقیق یا هدف گیری اختصاصی زنجیره های سبک برای اهداف درمانی، ابزارهایی شناسایی اختصاصی دارای حساسیت و ویژگی های بالا از جمله آنتی بادی های منوکلونال مورد نیاز هستند و بدین منظور تعیین دقیق اپی توپ های اختصاصی زنجیره های سبک حائز اهمیت خاصی است. ایمونوانفورماتیک شاخه ای از علم ایمونولوژی است که با به کارگیری اطلاعات زیستی موجود در کامپیوتر به تشخیص دقیق تر بیماری ها کمک می کند. هدف مطالعه حاضر بررسی و تعیین اپی توپ های فضایی زنجیره سبک ایمونوگلوبولین انسان توسط ایمونوانفورماتیک می باشد. توالی اسیدهای آمینه و ساختار سوم زنجیره سبک ایمونوگلوبولین مرجع انسان در پایگاه اطلاعاتی Protein Data Bank) PDB، ساختار دوم زنجیره سبک توسط نرم افزار Recognition Engine V 2.0 Protein Homology/analogy ) Phyre2) و اپی توپ های فضایی زنجیره سبک توسط نرم افزار CEP تعیین شدند. در این مطالعه 5 اپی توپ فضایی در دومین ثابت زنجیره سبک ایمونوگلوبولین انسان توسط نرم افزار CEP شناسایی شد. اپی توپ های فوق الذکر در ناحیه قرارگیری اسیدهای آمینه شماره 100 الی 214 واقع شده اند. در این پژوهش تعدادی از اپی توپ های فضایی دومین ثابت زنجیره سبک ایمونوگلوبولین انسان شناسایی شدند. این اپی توپ ها ابزارهای بسیار ارزشمندی جهت تولید آنتی بادی های مونوکلونال شناسایی کننده اختصاصی زنجیره سبک ایمونوگلوبولین انسان بوده و می توانند به طور بالقوه برای تولید کیت های تشخیص اختصاصی زنجیره سبک ایمونوگلوبولین، درمان برخی از بدخیمی های لنفوسیت B، تعیین نقشه اپی توپ های زنجیره سبک ایمونوگلوبولین انسان و مطالعات تکاملی مفید باشند.

Keywords:

اپی توپ فضایی , ایمونوگلوبولین انسان , زنجیره سبک , ایمونوانفورماتیک