ارزیابی متابارکدینگ مایکوبیوتای اندوفیت بذرهای کنجد و کاج به ترتیب در پاکستان و کل اروپا: الگوهای همزیستی معنیدار مابین اندوفیتهای قارچی با گونه های گیاهی رشد یافته در مکانهای جغرافیایی مختلف

اندوفیتهای بذرزاد با توجه به انتقال عمودی آنها، پتانسیل بهبود و گسترش جوانه زنی بذور ومتعاقبا رشد و نمو گیاه حائز اهمیت میباشند. آنها از طریق تولید فیتوهورمونهای مختلف، ترکیبات ضد میکروبی، ممانعت از بیماریزایی توسط بیمارگرها و نیز ازدیاد تولید آنزیمها و متابولیتهای ثانویه عمل میکنند و سبب بهبود و افزایش سازگاری گیاهان تحت تاثیر تنشهای زیستی و غیر زیستی در محیط میگردند. این مطالعه از طریق بررسی متابارکدینگ گروه های اندوفیت قارچی بذرهای دو گونه گیاهی کنجد ( به عنوان گونه کشت شده) و کاج (به عنوان گونه جنگلی) به ترتیب در دو مقیاس محلی (پاکستان) و کل اروپا از طریق ترکیب محصولات پی سی آر ناحیه ژنی ITS-rDNA با غلظت مولی یکسان به منظور تولید کتابخانه متاژنومی برای توالی یابی Illumina MiSeq و پس از حذف خطاهای خوانش با استفاده از نرم افزار CASAVA 1.8.2 و نهایتا تجزیه وتحلیل نتایج با استفاده از نرم افزارهای Qiime، Mothur ، Nephele و SEED2، اولین ارزیابی اجمالی در این زمینه را فراهم مینماید. مایکوبیوتای اندوفیت کلی بذور کنجد و کاج به ترتیب شامل 96 و 90 جنس قارچی از 20 و 47 مجموعه بذری جمعآوریشده از سرتاسر پاکستان و اروپا بود که 74 جنس قارچی جزء مایکوبیوتای اصلی شامل Strobilurus، Trichoderma، Nakazawaea، Chaetomium، Curvularia ، Sydowia، Malassezia، Eutypella، Periconia و ... در هر دو گروه بود. مایکوبیوم منحصربه فرد در کاج متشکل از 16 جنس (شامل Stagonospora، Elsinoe، Athelia، Acremonium، Calvulina و ...) و در کنجد متشکل از 22 جنس (شامل Glomus، Pichia، Cercospora، Neurospora، Kluyveromyces و ...) بود. مایکوبیوم اصلی بذرها نمایانگر ساکنان عمده بذرها بوده درحالیکه مایکوبیوم منحصربه فرد نشان دهنده جنسهای قارچی مرتبط با گونه گیاهی رشد یافته در کلیمای ویژه ناحیه جغرافیایی میباشند. بررسی اولیه گونه ها با نرم افزار SEED2 نشان داد که با اینکه بسیاری از گونه ها سبک زندگی ساپروفیتی و حتی مایکوپارازیت داشتند اما برخی نیز مانند Alternaria longissima به عنوان بیمارگر کنجد و گونه قارچی Lophodermium seditiosum به عنوان بیمارگر مهم درختان کاج جوان به شمار میروند، درعین حال .Sydowia sp و Diplodia sp. مسئول سر خشکیدگی درختان کاج شناسایی شده اند؛ بنابراین به منظور ممانعت از بروز بیمارگرهای مهاجم زمانی که احتمال انتقال از طریق مبادلات بینالمللی میرود، بایستی مراقبتهای کافی صورت گیرد.