بررسی ویژگیهای مولکولی یک جدایه ویروس وای سیب زمینی جداشده از محصول گوجه فرنگی ازشهرستان یزد بر پایه توالی قسمت هایی از ژنوم

گوجه فرنگی ) Lycopersicum esculentum Mill. ( یکی از محصولات مهم در ایران و بسیاری از کشورها است. بر پایه یک بررسی انجام شده در سال 1392 ویروس وای سیب زمینی به عنوان ویروس غالب آلوده کننده گوجه فرنگی در شهرستان یزد معرفی شده بود. دراین پژوهش قسمت هایی از ژنوم یک جدایه انتخابی از این ویروس با نام جدایه T5 افزونش و توالی یابی شد. پس از استخراج RNA کل از نمونه T5 ، با استفاده از آزمون RT-PCR نواحی مختلف CP ، NIb و P1 به کمک جفت آغازگرهای CPf/CPr ، 4T/Sprimerو P1/P2 افزونش و به ترتیب سه قطعه به طول 824 ، 1700 و 837 جفت بازی توالی یابی شد. نتایج به دست آمده از بررسی و مقایسهتوالی آمینواسیدی و نوکلیوتیدی نواحی P1 ، CP و NIb با دیگر توالی های موجود در بانک ژن، نشان داد که جدایه T5 متعلق به سویه NTN است

Keywords:

ژن P1 و پروتیین پوششی , گوجه فرنگی , PVY , RT-PCR